MUDPIT（Multidimensional Protein Identification Technology，多维蛋白质鉴定技术）是一种基于液相色谱（LC）和质谱（MS）的高通量蛋白质组学技术。它特别适用于复杂蛋白质混合物的鉴定和定量，如细胞裂解物、组织样本和亚细胞组分等。MUDPIT 技术能够提高蛋白质鉴定的深度和覆盖率，因此广泛应用于生物医学研究、药物开发和疾病机制研究。该技术最初在20世纪末被开发并迅速成为蛋白质组学研究中的方法之一。MUDPIT蛋白质组学结合多维液相色谱与质谱分析，能够同时分离和鉴定数千种蛋白质。在基础生物学研究中，MUDPIT蛋白质组学可以帮助研究人员揭示细胞内部复杂的蛋白质网络和信号传导路径。这有助于探索疾病的分子机制，尤其是在癌症、神经退行性疾病和感染性疾病的研究中。通过MUDPIT蛋白质组学，研究者能够识别疾病相关的蛋白质标记物，为新药研发和个性化治疗提供科学依据。此外，MUDPIT蛋白质组学也在农业、生物技术和环境科学中发挥作用，例如改良作物的抗逆性、优化微生物代谢途径以及监测环境污染等。

一、MUDPIT蛋白质组学原理

MUDPIT 主要利用多维液相色谱（Multidimensional Liquid Chromatography, MDLC）结合串联质谱（Tandem Mass Spectrometry, MS/MS）来解析复杂蛋白质混合物。它的核心思想是通过不同维度的色谱分离策略，降低样本复杂性，从而提高蛋白质鉴定的效率。

二、MUDPIT蛋白质组学技术流程

1、样品制备

（1）蛋白提取：从细胞、组织或体液中提取蛋白质。

（2）蛋白质酶解：使用胰蛋白酶（Trypsin）或其他蛋白酶将蛋白降解成肽段。

（3）样品脱盐和浓缩：去除盐分并浓缩肽段，以提高质谱灵敏度。

2、多维液相色谱分离（MDLC）

MUDPIT多维蛋白质鉴定技术的核心在于采用非胶体液相色谱（Gel-Free LC）策略，通常结合：

（1）第一维分离：强阳离子交换色谱（SCX, Strong Cation Exchange）

根据肽的电荷特性进行分离。通过不同盐梯度洗脱不同带电性质的肽段。

（2）第二维分离：反相液相色谱（RP, Reverse Phase）

利用肽的疏水性进行进一步分离。一般使用 C18 柱和梯度洗脱方式。通过 SCX-RP 的双重分离，样品的复杂度大幅降低，有助于提高低丰度蛋白的鉴定能力。

3、串联质谱分析（MS/MS）

（1）一级质谱（MS1）：测定肽的质荷比（m/z）。

（2）二级质谱（MS2）：对选定肽段进行碎裂（CID, Collision-Induced Dissociation），获取肽的序列信息。

4、数据分析

（1）数据库搜索：使用 SEQUEST、Mascot、MaxQuant 等搜索软件，将 MS/MS 谱图与数据库中的蛋白质序列比对，鉴定蛋白身份。

（2）假发现率（FDR, False Discovery Rate）控制：采用目标-诱饵（Target-Decoy）策略减少错误匹配。

三、MUDPIT蛋白质组学的技术优势

1、无胶体电泳（Gel-Free），避免电泳过程中蛋白丢失和偏差。

2、适用于复杂蛋白质组，如膜蛋白、信号通路蛋白和翻译后修饰蛋白。

3、比单一 LC-MS 技术具有更高的鉴定深度和灵敏度。

4、可与不同的质谱仪（如 Orbitrap、Q-TOF）结合，灵活性强。

MUDPIT多维蛋白质鉴定技术在大规模蛋白质鉴定和定量分析中发挥作用。随着质谱技术的进步，MUDPIT 的分辨率和灵敏度不断提高。凭借丰富的经验和专业的技术，百泰派克生物科技能够为您的研究提供精确的蛋白质鉴定和分析服务。通过与我们合作，您将获得详尽的蛋白质组信息，助力您的科研项目取得更多突破。欢迎联系我们，了解更多关于MUDPIT蛋白质组学的定制化解决方案。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

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