从头抗体测序（De Novo Antibody Sequencing）是一种利用先进的质谱技术和生物信息学工具对抗体的氨基酸序列进行完整解析的技术。不同于传统的基因组测序或抗体基因库方法，从头抗体测序直接基于抗体的蛋白质序列进行分析，能够在没有任何基因信息或模板的情况下，准确解析出抗体的完整序列。这一技术突破了基因测序在抗体变异区域（CDR）识别上的局限性，特别是在单克隆抗体、嵌合抗体或人源化抗体的开发和生产中具有应用价值。从头抗体测序在生物制药、诊断试剂开发以及科研领域发挥作用。例如，在抗体药物研发中，抗体的氨基酸序列是药物设计和优化的基础。通过从头抗体测序可以全面解析抗体序列，优化抗体亲和力、特异性和稳定性。此外，在生物仿制药的开发中，这项技术帮助企业准确还原原研抗体的结构信息，确保生物仿制药在结构和功能上的高度一致性。这一技术也在免疫诊断试剂开发、自身免疫疾病研究等领域展现出巨大的潜力。

一、从头抗体测序的原理

从头抗体测序的核心原理是利用高分辨率质谱（High-Resolution Mass Spectrometry, HRMS）对抗体样本进行肽段分析，获得抗体的一级氨基酸序列信息。具体流程包括以下几个关键步骤：

1、抗体样本的酶解

将抗体分子通过不同的蛋白酶进行酶解，得到多种具有重叠序列的肽段。

2、肽段分离与质谱分析

从头抗体测序利用高效液相色谱（HPLC）将抗体的肽段进行分离并通过串联质谱（LC-MS/MS）对每个肽段进行精确测定，获取肽段的质谱图谱。

3、序列拼接

从头抗体测序使用生物信息学工具将获取的肽段质谱数据进行比对和拼接，重构完整的抗体氨基酸序列，包括重链和轻链的可变区（VH和VL）及恒定区。

4、翻译后修饰分析

检测抗体分子中的翻译后修饰（如糖基化、氧化、脱氨基等），确保测序结果的完整性和准确性。

二、从头抗体测序的注意事项

1、样本纯度

样本纯度对从头抗体测序至关重要，杂质可能影响酶解效果和质谱数据的准确性，因此需严格控制样本纯度。

2、酶解策略优化

从头抗体测序使用多种蛋白酶进行酶解以提高序列覆盖率，避免序列拼接时出现空白或错误。

3、质谱数据的准确性

从头抗体测序使用高分辨率质谱仪确保获得高质量的肽段质谱数据，避免因仪器灵敏度不足导致序列错漏。

4、生物信息学分析

从头抗体测序数据分析需结合先进的生物信息学工具进行序列拼接和修饰识别，确保结果的准确性和可重复性。

百泰派克生物科技提供高效、精准的测序服务；我们的团队在抗体样本纯化、质谱分析和生物信息学数据解析方面积累了丰富的经验，能够在确保数据准确性的基础上，为客户提供完整的抗体序列信息。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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